Biol. Mol.
Proteina con funzione regolatoria che aumenta la frequenza della trascrizione di un gene. Di solito si tratta di un fattore di trascrizione che riconosce e si lega ad una breve sequenza di nucleotidi in prossimità del promotore del gene regola il promotore stesso o un enhancer trascrizionale.
Enzimologia
Composto che aumenta il tasso di potenza di un enzima, la reazione di un catalizzatore diverso o il suo substrato.
Nei procarioti, un promotore (senso 1a) ha due domini separati caratteristici, il primo dominio di legame è una specifica regione del DNA in genere si trova vicino al promotore del gene e il secondo è un dominio di interazione con l’RNA polimerasi.
Attivazione con RNA polimerasi
In questi casi, l’attivazione viene effettuata:
- facilitando il legame della polimerasi al promotore (il promotore è vincolato da un DNA dominio e l’altro, come nel caso della polimerasi RNA operone lac; l’attivazione di questi si verifica anche in presenza di un repressore trascrizionale)
- per interagire con il gate (cioè, con la RNA polimerasi già legato al DNA a doppia elica) in modo tale che possa avvenire un cambiamento conformazionale a RNA polimerasi o DNA, il complesso chiuso passa allo stato aperto e inizia la trascrizione. Un attivatore può anche esercitare il suo effetto a distanza. In questi casi, l’attivatore (es NTRC) si lega ai segmenti di DNA che possono essere situati a poche centinaia di paia di basi del promotore (5 ‘direzione), e l’interazione con solo polimerasi RNA è possibile se il DNA viene piegato ei siti di legame dell’attivatore a DNA e RNA polimerasi al DNA sono vicini l’uno all’altro.
Negli organismi eucariotici, gli attivatori hanno anche due domini distinti, ma raramente interagiscono direttamente con l’RNA polimerasi. Piuttosto che promuovere il legame della RNA polimerasi DNA (complesso di inizio) indirettamente in due modi diversi:
- l’attivatore interagisce solo con proteine o con complessi proteici che fanno parte del complesso trascrizionale, diversi RNA polimerasi (es: un co-attivatore o trascrizione del TFIID fattore.), che a loro volta si legano al polimerasi RNA che si lega al DNA per formare complessi corrispondenti e permette così l’inizio della trascrizione del promotore;
- l’attivatore attira i nucleosomi modificatori e produce un cambiamento conformazionale nella regione cromatina vicino al gene in questione all’RNA-polimerasi per essere in grado di legarsi al DNA e formare il corrispondente complesso di iniziazione trascrizionale. L’attivatore che è in grado di interagire direttamente con la polimerasi, senza l’aiuto di coattivatori, viene chiamato “trans-attivatore”.
