RFLP

• dopo aver isolato il DNA genomica
• digerisco tutto il genoma con enzimi di restrizione
• migrazione elettroforetica

Ha dei limiti perchè non riesco a distinguere bene i profili (bande tutte vicine vicine) con tutto il DNA genomico, quindi posso fare un RFLP riducendo il numero di bande trasferendo su un filtro di cellulosa le bande della migrazione elettroforetica e andare ad ibridare con sonde ripetute che sono specifiche di quella specie e rispetto a quello smiar riesco ad avere una definizione più elevata.

• dopo aver isolato il DNA genomica
• digerisco tutto il genoma con enzimi di restrizione
• migrazione elettroforetica

Ha dei limiti perchè non riesco a distinguere bene i profili (bande tutte vicine vicine) con tutto il DNA genomico, quindi posso fare un RFLP riducendo il numero di bande trasferendo su un filtro di cellulosa le bande della migrazione elettroforetica e andare ad ibridare con sonde ripetute che sono specifiche di quella specie e rispetto a quello smiar riesco ad avere una definizione più elevata.

Le sonde sono sia fredde che calde come dette prima.
Il dendrogramma è un diagramam che accomuna i ceppi grazie all'indice di similarità che si rifà al numero di coppie di bande dei profili confrontati che sono simili.
Ha comunque altri svantaggi oltre alla cattiva risoluzione:
• interpretazione soggettiva
• scarsa riproducibilità inter-laboratori
• assenza di un sistema di nomenclatura universale.