• del target: più intuitiva, si attua tramite una PCR quindi ha sensibilità elevata, un'elevata specificità, è rapida, può essere allestita mediante PCR convenzionale oppure modifiche della PCR classica tra cui la SDA.
Una volta effettuata la PCR si fà la verifica con il gel d'agarosio, la prsenza del bromuro d'etidio che ci permette di vedere la banda del DNA perchè carico positivamente si intercala nel DNA.
• del target: più intuitiva, si attua tramite una PCR quindi ha sensibilità elevata, un'elevata specificità, è rapida, può essere allestita mediante PCR convenzionale oppure modifiche della PCR classica tra cui la SDA.
Una volta effettuata la PCR si fà la verifica con il gel d'agarosio, la prsenza del bromuro d'etidio che ci permette di vedere la banda del DNA perchè carico positivamente si intercala nel DNA.
Un passo successivo è verificare la PCR ovvero un'ibridazione sul prodotto di PCR, aggiungere uno step in più di specificità ed in questo caso la sonda può essere immobilizzata con una strisciolina su substrato, si aggiunge l'amplicone che può essere marcato in modo tale da consentirne la rilevazione, in questo caso con sistema biotina strptavidina coniugata con una perossidasi che manifesta l'avvenuta PCR con la formazione di un colore, aggiungendo un substrato cromogeno visualizzerò una banda colorata evidenziabile;
• della sonda
• del segnale
il denominatore comune è la presenza di una sequenza specie-specifica del microrganismo possibilmente direttamente dal campione biologico altrimenti in coltura.
