Partiamo dagli albori. Un iter diagnostico convenzionale come procede? • Arriva un campione in laboratorio: polimicrobico (come le feci, tampone vaginale o orale) o monomicrobico (come il sangue, il liquor, le urine se prelevate con puntura sovrapubica così da non entrare in contatto con la flora genitale o un campione respiratorio prelevato con un broncolavaggio […]
Archivio Categoria: Biotecnologie Microbiche
È una disciplina che si propone di esplorare le potenzialità dell’utilizzo di microrganismi per diverse applicazioni biotecnologiche.
Tratta i diversi approcci metodologici mirati alla selezione ed al miglioramento genetico delle colture industriali, prende in considerazione esempi di produzione, caratterizzazione ed impiego dei principali prodotti delle fermentazioni industriali.
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• Le sequenze nucleotidiche sono spottate. • La loro lunghezza è di 25 basi. • Non si usa una sola sonda per spot;
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Si usano dei nanochip, cioè l'area dove si lega la proteina è nell'ordine dei nanometri. Per valutare i segnali si usa la microscopia a forza atomica. Il vantaggio di questa tecnica è che riduco i reagenti da usare e tutti i materiali di prima necessità. I problemi di queste tecniche • difficoltà della rapida identificazione […]
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Ciascuna posizione del vetrino è occupata da una proteina. 1. Le proteine native sono spottate sul vetrino 2. Aggiungo una proteina X 3. spottate proteine native + alcune proteine legate alla proteina X La proteina X è semrpe marcata con un fluorocromo o rilevabile tramite test della fosfatasi. Della proteina X conosco la sequenza ma […]
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Produce una quantità enorme di informazioni. In due estratti cellulari (A/B) dovrò marcarli con due molecole diverse. Nella pratica le proteine di A e B competeranno per arrivare a legarsi al ligando. Ottengo 3 spot diversi: • Spot verde: si è legato A • Spot Rosso: si è legato B • Spot Giallo: sia A […]
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I microarray di proteine, sono strumenti utili per molte applicazioni della proteomica. Le piastre in nitrato di cellulosa sono il miglior substrato possibile per microarray di proteine, ad esempio gli array proteici diretti ed i microarray proteici in fase inversa. La molteplicità degli spot proteici evidenziati sulla superficie della piastra permettono la visione simultanea di […]
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Lo studio del proteoma (tutte le proteine di un organismo). vuol dire conoscere: • le proteine che sono presenti • definire la loro struttura • studiare le interazioni di queste proteine • come si possono correlarle con la genomica Il proteoma è un'entità dinamica, perchè cambia continuamente all'interno del solito microrganismo.
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studiare dal punto di vista ecologico gli ambienti estremi dove ci sono microrganismi. Es.a Richmond c'è un ambiente acido e la comunità di microrganismi forma un biofilm (di colore rosato). Inoltre trovati altri nanorganismi (appartenenti agli archea con estroflessioni particolari). Un'altra zona è il mar dei Sargassi dove crescono le alghe in vere aree giganti […]
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Se gli antibiotici che fungono da mediatori nella comunicazione la loro scoperta sarà diretta da uno screening metagenomico di cloni per i composti segnale come i composti inibitori Un sorprendente risultato di un gruppo di Davies ha indicato che una concentrazione sub-inibitoria di molti antibiotici induce il quorum sensing. Il sistema di screening è stato […]
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La scoperta di piccole molecole tramite la metagenomica funzionale è concentrata su antibiotici per le applicazioni farmaceutiche e per il loro ruolo nell'ecosistema. Gli antibiotici tradizionalmente scrinati sono da molecole che inbiscono la crescita batterica a antibiotici delle librerie metagenomiche.